Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms