Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOBPA7XYQ1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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