Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms