Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFGAP3Q9NP61 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms