Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM55Q9BYV6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms