Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TINF2Q9BSI4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms