Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM7Q9BQ49 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM7Q9BQ49 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms