Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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