Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC12Q8WUD4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms