Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SEMA6DQ8NFY4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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