Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SYT9Q86SS6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYT9Q86SS6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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