Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIN7

RGL3, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGL3Q3MIN7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGL3Q3MIN7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGL3Q3MIN7 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms