Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms