Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CKAP5Q14008 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CKAP5Q14008 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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