Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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CUL4AQ13619 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CUL4AQ13619 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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