Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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