Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms