Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP160Q12769 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP160Q12769 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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