Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LTBQ06643 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LTBQ06643 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LTBQ06643 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LTBQ06643 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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