Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms