Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HOXC5Q00444 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms