Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP53609 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms