Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NESP48681 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NESP48681 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NESP48681 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NESP48681 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms