Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5OP48047 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms