Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ETV4P43268 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ETV4P43268 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ETV4P43268 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms