Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IFI27P40305 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IFI27P40305 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms