Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CASQ1P31415 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASQ1P31415 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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