Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA2P26232 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA2P26232 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms