Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB3P16520 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB3P16520 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB3P16520 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GNB3P16520 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GNB3P16520 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GNB3P16520 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms