Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN11O75508 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN11O75508 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN11O75508 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN11O75508 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN11O75508 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN11O75508 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN11O75508 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN11O75508 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN11O75508 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN11O75508 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN11O75508 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN11O75508 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN11O75508 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms