Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LRRTM2O43300 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LRRTM2O43300 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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