Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA8SH3BPF8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms