Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms