Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PALM2-AKAP2B1ALY0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PALM2-AKAP2B1ALY0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PALM2-AKAP2B1ALY0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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