Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFR3BQ9Y2G0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms