Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms