Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNAL1Q9UBT7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms