Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MKS1Q9NXB0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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MKS1Q9NXB0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MKS1Q9NXB0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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