Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZDHHC18Q9NUE0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms