Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms