Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FANCFQ9NPI8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms