Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB18Q9NP72 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms