Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KIAA1549Q9HCM3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms