Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFDQ9GZP0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFDQ9GZP0 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFDQ9GZP0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDGFDQ9GZP0 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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