Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CEP44Q9C0F1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEP44Q9C0F1 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms