Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF518BQ9C0D4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF518BQ9C0D4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF518BQ9C0D4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF518BQ9C0D4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF518BQ9C0D4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF518BQ9C0D4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms