Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CELF4Q9BZC1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms