Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MED12Q93074 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MED12Q93074 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MED12Q93074 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms