Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms