Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STRADAQ7RTN6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms